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更多 发布于:2020-02-02 00:49
2019nCoVR
2019新型冠状病毒信息库


更新日志 最后更新: 2020-02-01 18:36:42

71 病毒株
28 提交单位
14 采样地点



关于冠状病毒

冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。某些冠状病毒会感染人类并引起疾病,比如中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS),其症状可从普通感冒到重症肺部感染。此次在武汉首先发现的冠状病毒是一种先前尚未在人类中发现的病毒株系,被WHO命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。


NCBI的病毒分类工具PASC将2019-nCov分类为

严重急性呼吸综合征相关冠状病毒种(Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus)
该种还包含2003年爆发的SARS病毒
两者基因组序列相似度为80%。


在已发布的数据中,2019-nCoV与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因组序列相似性最高,为88%。

基因组数据提交
冠状病毒序列检索





基金支持

该数据库由国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建设,并获得中国科学院“十三五”信息化建设专项(XXH13505-05)、中国科学院地球大数据先导A类专项(XDA19050302)、中国科学院基因组科学数据中心能力建设(0202)、中国科学院青年创新促进会、中国科学院关键技术人才等项目支持。


联系方式

国家生物信息中心 (CNCB) / 中国科学院北京基因组研究所 (BIG)
国家基因组科学数据中心 (NGDC) / 生命与健康大数据中心 (BIGD)
电子邮箱: GWH@big.ac.cn 电话: +86 (10) 8409-7340 传真: +86 (10) 8409-7200
联系地址: 北京市朝阳区北辰西路一号院104号




国家基因组科学数据中心



面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,建立生命健康组学大数据储存、整合与挖掘分析研究体系,研发生物多样性与健康大数据汇交、共享与管理平台,发展大数据系统解析与转化应用的新技术和新方法,建成支撑我国生命科学发展、国际知名的基因组科学数据中心。

https://bigd.big.ac.cn/

相关链接

NCBI冠状病毒科序列
  • 2019新型冠状病毒
  • 冠状病毒所有序列
  • 冠状病毒全基因组序列
  • 感染人的冠状病毒全基因组序列

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科普知识
  • 冠状病毒
  • 2019新型冠状病毒
  • SARS病毒
  • MERS病毒

相关文献
  • 2019新型冠状病毒 (PubMed)
  • 冠状病毒 (PubMed)
  • 2019新型冠状病毒 (EuropePMC)
https://bigd.big.ac.cn/ncov/
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